diff --git a/scripts/update.sh b/scripts/update.sh
index 1feaf186..0cee0001 100755
--- a/scripts/update.sh
+++ b/scripts/update.sh
@@ -14,6 +14,7 @@ ASSUME_YES=0
 SKIP_BACKUP=0
 SKIP_DIRTY_CHECK=0
 FORCE_PULL=0
+BOOTSTRAP_GIT_REPO=0
 INSTALL_ARGS=()
 
 # 项目身份验证标识文件（至少需要其中 2 个）
@@ -158,8 +159,22 @@ check_git_installed() {
   command -v git >/dev/null 2>&1 || ctms_fail "未检测到 git 命令，请先安装 Git"
 }
 
-check_is_git_repo() {
-  git rev-parse --git-dir >/dev/null 2>&1 || ctms_fail "当前目录不是 Git 仓库"
+detect_git_repository() {
+  if git rev-parse --git-dir >/dev/null 2>&1 && git rev-parse --verify HEAD >/dev/null 2>&1; then
+    BOOTSTRAP_GIT_REPO=0
+  else
+    BOOTSTRAP_GIT_REPO=1
+  fi
+}
+
+initialize_git_repository() {
+  [[ "$BOOTSTRAP_GIT_REPO" -eq 1 ]] || return 0
+
+  ctms_step "接管现有部署目录"
+  if [[ ! -d "$CTMS_ROOT_DIR/.git" ]]; then
+    git init "$CTMS_ROOT_DIR" >/dev/null 2>&1 || ctms_fail "初始化 Git 仓库失败"
+  fi
+  ctms_ok "已初始化 Git 仓库，准备同步远程代码"
 }
 
 get_current_branch() {
@@ -568,8 +583,14 @@ main() {
   cd "$CTMS_ROOT_DIR"
 
   check_git_installed
-  check_is_git_repo
-  check_working_directory
+  detect_git_repository
+  if [[ "$BOOTSTRAP_GIT_REPO" -eq 1 ]]; then
+    ctms_warn "部署目录缺少可用的 Git 历史，将从指定仓库接管现有部署"
+    # 必须先确认这是 CTMS 目录，避免在任意目录中初始化并覆盖文件。
+    verify_project_identity
+  else
+    check_working_directory
+  fi
   resolve_repo_url
   setup_git_credentials
   pick_remote_ref
@@ -577,6 +598,7 @@ main() {
 
   # 先验证当前项目身份
   verify_project_identity
+  initialize_git_repository
 
   # 创建备份
   create_backup_tag